Фундамент совместного учебно-научного центра был заложен еще в 1999 году при создании компанией SWsoft (сейчас известной как Parallels) студенческой исследовательской лаборатории на кафедре вычислительной математики МФТИ. Несколькими годами позже успешный опыт работы лаборатории и бурный рост ее учредителей привел к созданию совместного учебно-научного центра Parallels-МФТИ действующего на основании договоров, заключенных между вновь тогда созданной кафедрой информатики, кафедрой вычислительной математики, МФТИ, компаниями Parallels и Acronis. Следующим, качественным шагом развития университетской программы компаний Parallels и Acronis стало создание на основе работающего в МФТИ совместного учебно-научного центра базовой кафедры «теоретической и прикладной информатики» в 2010 году и приобретение ей статуса «межфакультетской» в 2014 году. В 2016 году подразделение серверной виртуализации компании Parallels стало самостоятельной компанией, участвующей в университетской программе,  работающей под брендом Virtuozzo.

Цель центра — подготовка высококвалифицированных специалистов, способных успешно работать на переднем крае разработки программного обеспечения с общепринятым менеджментом западного образца; повышение уровня выпускников МФТИ за счет приобретения ими опыта проведения учебных научно-исследовательских работ, прикладных и фундаментальных исследований на профессиональном уровне.
Основные задачи центра — привлечение студентов всех факультетов МФТИ к прикладным и фундаментальным исследованиям в Computer Science, организация и поддержка студенческих научно-исследовательских работ под руководством опытных специалистов компаний и ученых МФТИ. Доведение результатов этих исследований до реализации в программном обеспечении.

Опыт организации и работы совместного учебно-научного центра был успешно использован в  университетских программах с другими ВУЗами. В результате были организованы студенческие научно-исследовательские лаборатории в НГУ, МГУ, СПбАУ, КАИ.

Почему МФТИ

Современный рынок информационных технологий развивается очень быстро, и ключ к успеху – это умение приспосабливаться к его мгновенно изменяющимся условиям и потребностям. Способность к быстрому обучению вместе с глубокими теоретическими знаниями составляют основные преимущества выпускников МФТИ. Именно поэтому МФТИ рассматривается как идеальная основа для подготовки ИТ-специалистов, готовых к работе в сложных проектах.